Negativni IRR se pojavi, ko je skupni znesek denarnih tokov, ki jih povzroči naložba, manjši od zneska začetne naložbe. V tem primeru bo naložbeni subjekt imel negativno donosnost naložbe. Podjetje, ki za morebitno naložbo izračuna negativni IRR, ne bi smelo vlagati.
IRR pomeni notranja stopnja donosa, ki je diskontna stopnja, ki bi ob uporabi za vrsto denarnih tokov privedla do sedanje vrednosti, ki ustreza znesku začetne naložbe.